متاسفانه برخی از مناطق کشور امسال دچار بلایای طبیعی شدند. بسیاری از داوطلبان کنکور سراسری 98 ساکن مناطق سیل زده کشور، خواستار به تعویق افتادن زمان برگزاری کنکور سراسری 98 بودند. ولی سازمان سنجش به دلیل برنامه ریزی های انجام گرفته با تقاضای به تعویق انداختن کنکور سراسری 98 موافقت نکرد. با این حال در تاریخ 98/4/3 رئیس جمهور سهمیه داوطلبان کنکور مناطقی که دچار بلایای طبیعی شده‌اند، را به سازمان سنجش ابلاغ کرد.